Родительный падеж имеет формальное выражение с помощью 12-вариантов аффикса -нын. Основкым значением родительного падежа является выражение определительных принадлежностных отношений.

От именительного падежа, выступающего с такой же функцией, родительный падеж отличается наличием формального показателя, а также определенными семантико-речевыми условиями, в которых эти падежи используются.

Выполняя функцию приименного определения, родительный падеж требует постановки определяемого слова с аффиксом принадлежности 3-го лица.

Родительный падеж выражает:

1) Название конкретного обладателя предмета: Карабайдын коюн он сегиз жылча бактым (К. Баялинов). ‘Я пас озец Карабая около восемнадцати лет’. Тотойдун уйү жанаша жерде (Ч. Айтматов). ‘Дом Тотоя рядом’.
2) Отношения родства: Табылды — атамдын бир тууган иниси (К. Баялинов). ‘Табылды — родной (младший) брат моего отца’. Ал — Ажардын энесинин мүрзөсү (К. Баялинов). ‘Это могила матери Аджар’.
3) Отношения должности, профессии к месту работы, деятельности: Тарбиячы мени мектептин директоруна ээрчитип
кирди. ‘Воспитатель повел меня к директору школы’. МТСтин агроному өзгөчө «Беш-Таш» колхозуна токтолду (Ч. Айтматов). ‘Агроном МТС особо остановнлся на колхозе «БешТаш»’. Жапар райкомдун инструктору болуп иштөөчү (К. Баялинов). ‘Джапар работал инструктором райкома’.
4) Целый предмет, часть которого названа определяемым: Чокоюмдун таш таманы ыдырап түшүп калыптыр (К. Осмоналиев). ‘Подметка моего валенка отпоролась и отлетела’.
5) Предмет, из которого сделано или произошло определяемое: Кургак-Сай кыштагындагылар кышында кардын суусун ичишчү. ‘Жители Кургак-Сая зимой пили снеговую воду’. Ак буудайдын унунан нан жасашты. ‘Из пшеничной муки приготовили хлеб’.
6) Место или время, к которому относится определяемое: Бизди Фрунзенин эмгекчилери тосуп чыкты (К. Баялннов). ‘Нас вышли встречать трудящиеся Фрунзе’. Оштун пахтачылары да, Тянь-Шандын малчылары да быйыл зор жетишкентерге ээ болушту. ‘Ошские хлопкоробы и животноводы Тянь-Шаня добились в этом году больших успехов’. Майдын кечки салкын жели сокту (К. Баялинов). ‘Подул прохладный майский вечерний ветерок’.
7) Лицо, предмет, обладающне каким-либо качеством, свойством, выраженным определяемым: Мейли, чачырай берсин. андан кишинин сулуулугу кемийт беле! (Ч. Айтматов). 'Пускай заносится (возносится?), разве от этого красота человека убавится!’ Дүйнөнүн тазалыгына, адамдын тазалыгына рахмат! — дедим (Ч. Айтматов). ‘Спасибо чистоте мира, чистоте человеческой души!—сказал я’.
8) В качестве определяемого может выступать причастие или имя действия. В этом случае определение в родительном падеже обозначает логический субъект действия, выраженного определяемым: Акбардын айткандары абдан туура
(А. Убукеев).‘Все сказанное Акбаром очень верно’. Алыстан-алыстан карышкырлардын улуганы угула баштады (К. Баялинов). ‘Далеко-далеко стало слышно, как завыли волки (волчий вой)’. Если определяемое образовано от глагола страдательного залога, то определение обладает значением логического объекта: Кеңешмеде мамлекетке эт тапшыруу боюнча алынган милдеттенменин орундалышы, талкууланды. ‘На совещании был рассмотрен вопрос о выполнении обязательств по сдаче государству мяса’. Ош областынын пахтачылары түшүмдүн жогорулашы үчүн талыкпай эмгектенип жатышат. ‘Хлопкоробы Ошской области самоотверженно трудятся над повышением урожайности хлопка’.
9) Родительный падеж, образуя словосочетания из повторяющихся однокорневых словоформ, выражает усилительное и выделительное значение: Ал ошол үчүн кыраандын кырааны (К. Осмонкулов). ‘Он ловкий из ловких’. Бул ат — күлүктүн күлүгү. ‘Этот конь скакун из скакунов’.

Характерная особенность родительного падежа — отсутствие употребляющихся с ним послелогов. Но с родительным падежом сочетаются служебные имена, которые, выступая б падежных формах с пространственным значением, выполняют близкую к послелогам функцию: мектептин алдында ‘перед школоп’. Отряд токойдун артынан чыкты. ‘Отряд вышел из-за леса’. Машина үйдүн жанына токтоду. ‘Машина остановилась около дома’.