И в корнях, и в аффиксах сочетание йотированных букв или звука [й] с долгим гласным пишется следующим образом: ёо, юу - аюу, коюу; боё+оо - боёо, ая+оо - аёо, тая+оо - таёо, жай+уу - жаюу, кой+уу - коюу и т. д.
Источник:
Правила правописания кыргызского языка